Biosamples: 108 Seq. Projects: 161 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STUDY INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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GOLD Study ID
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Gs0142245 |
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Study Name
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Enriched cells from switchgrass and soil in EcoFAB chamber, Walnut Creek, California, United States |
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Other Names
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NCBI Umbrella Bioproject Name |
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NCBI Umbrella Bioproject Accession
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SRA Studies |
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Legacy ER Study ID
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Legacy GOLD ID
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Added By | JGI automated process on 2019-05-14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified By | JGI automated process on 2020-05-21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PI | Trent Northen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description
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The goal of this study is to characterize the physical, chemical, and genetic factors mediating interactions of organisms using controlled laboratory ecosystems combined with omics techniques; to better understand the dynamics of interactions in microbial and plant-microbe communities; and to assess the functional potential of plant-associated microbes and transcriptomics to characterize their interactions with plants. |
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Relevance
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Study Information Visibility
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Public | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metagenomic Study |
Yes |
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Publication |
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Is GEBA |
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Is HMP |
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ECOSYSTEM CLASSIFICATION
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Ecosystem |
Engineered |
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Ecosystem Category |
Lab enrichment |
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Ecosystem Type |
Defined media |
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Ecosystem Subtype |
Unclassified |
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Specific Ecosystem |
Unclassified |
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Ecosystem Path ID |
4287 |
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STUDY COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Biosamples |
108
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Number of Organisms |
53
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Number of Seq Projects |
161
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Number of Analysis Projects |
161
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Number of Related Studies
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