Biosamples: 0 Seq. Projects: 108 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STUDY INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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GOLD Study ID
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Gs0135012 |
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Study Name
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Genomic analyses of the natural microbiome of Caenorhabditis elegans |
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Other Names
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NCBI Umbrella Bioproject Name |
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NCBI Umbrella Bioproject Accession
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SRA Studies |
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Legacy ER Study ID
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Legacy GOLD ID
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Added By |
JGI automated process
on 2018-06-01 |
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Last Modified By |
JGI automated process
on 2019-09-06 |
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PI | Buck Samuel | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description
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Genome sequences for 59 bacterial strains of the natural microbiome of Caenorhabditis elegans. These strains are selected based on their phylogenetic relatedness to the core microbiota of C. elegans, many of which robustly colonize the its gut and have demonstrated impact on host fitness and fruit decomposition. Collectively, they represent 26 genera and are isolated from C. elegans colonizing a wide range of natural habitats, from rotten fruit to plant stems to invertebrate vectors. |
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Relevance
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Study Information Visibility
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Public | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metagenomic Study |
No |
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Publication |
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Is GEBA |
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Is HMP |
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ECOSYSTEM CLASSIFICATION
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Ecosystem |
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Ecosystem Category |
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Ecosystem Type |
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Ecosystem Subtype |
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Specific Ecosystem |
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Ecosystem Path ID |
1 |
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STUDY COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Biosamples | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Organisms |
108
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Number of Seq Projects |
108
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Number of Analysis Projects |
113
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Number of Related Studies
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0 |
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