Biosamples: 0 Seq. Projects: 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STUDY INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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GOLD Study ID
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Gs0113857 |
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Study Name
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Kryptonia, defining a new bacterial candidate phylum from geothermal springs |
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Other Names
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NCBI Umbrella Bioproject Name |
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NCBI Umbrella Bioproject Accession
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SRA Studies |
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Legacy ER Study ID
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Legacy GOLD ID
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Added By | Dimitrios Stamatis on 2014-12-01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified By | JGI automated process on 2019-09-06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PI | Emiley Eloe-Fadrosh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description
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Here we detail the identification and characterization of Kryptonia, a novel bacterial candidate phylum from samples collected from four distinct geothermal springs. The four sampling sites host similar environmental parameters, including a circumneutral pH and temperatures 75-80°C. This phylum has eluded detection in previous biodiversity surveys due to 16S rRNA primer biases. Population-level genome reconstruction from metagenomic data yielded four composite genomes from this novel candidate phylum. |
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Relevance
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Study Information Visibility
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Public | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metagenomic Study |
No |
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Publication |
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Is GEBA |
No |
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Is HMP |
No |
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ECOSYSTEM CLASSIFICATION
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Ecosystem |
Environmental |
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Ecosystem Category |
Aquatic |
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Ecosystem Type |
Unclassified |
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Ecosystem Subtype |
Unclassified |
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Specific Ecosystem |
Unclassified |
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Ecosystem Path ID |
3984 |
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STUDY COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Biosamples | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Organisms |
21
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Number of Seq Projects |
21
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Number of Analysis Projects |
36
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Number of Related Studies
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0 |
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