Studies
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49,623 |
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Biosamples
|
133,250 |
|
Sequencing Projects
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410,882 |
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Analysis Projects
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321,341 |
| Organisms | 410,938 |
| PROJECT INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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GOLD Project ID
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Gp0000107
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Project Name
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Gallus gallus BN/SsNHsdMCW
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Other Names
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Legacy ER Project ID
|
10086
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Legacy GOLD ID
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Gc00599, Gi0010086
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| NCBI BioProject Name | Gallus gallus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NCBI BioProject ID
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13342 |
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NCBI BioProject Accession
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PRJNA13342 |
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NCBI Locus Tag
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NCBI BioSample Accession
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SAMN02981218 |
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| PI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Added By |
Nikos Kyrpides
on 2007-11-27 |
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| Last Modified By |
Supratim Mukherjee
on 2017-03-29 |
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| Project Comments |
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Project Status
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Permanent Draft
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Project Relevance
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Sequencing Center
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Washington University in St. Louis
(USA)
Wellcome Trust Sanger Institute (United Kingdom) |
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Collaborating Institute
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The Roslin Institute
(United Kingdom)
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Funding Agency
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NIH
(USA)
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Project Description
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Gallus gallus 12X 454 assembly
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| Is JGI Project |
No
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Project Information Visibility
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Public | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROJECT TYPE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Specimen
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Organism |
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Nucleic Acid
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DNA |
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Sequencing Strategy
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Whole Genome Sequencing
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| EXTERNAL PROJECT LINKS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Project Information
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Database
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Genome Publications
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Nature
Sequence and comparative analysis of the chicken genome provide unique perspectives on vertebrate evolution.
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Other Publications
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| SRA Experiment |
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| PROJECT COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Study |
Gallus gallus BN/SsNHsdMCW |
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| Organism |
Gallus gallus BN/SsNHsdMCW |
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| Analysis Projects |
Gallus gallus BN/SsNHsdMCW |
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| Number of Analysis Projects (AP) |
1 |
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| Number of Derived Analyis Projects (DAP) |
0
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| SEQUENCING INFORMATION | |
|---|---|
|
Sequencing Status
|
Complete |
| Sequencing Quality (MIGS-31) |
Level 2: High-Quality Draft |
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Finishing Goal
|
Level 6: Finished |
|
Contamination Screening Input
|
|
|
DNA Amplification Method
|
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|
Sequencing Comments
|
|
|
DNA Amplification Kit
|
|
|
Sequencing Technology
(MIGS-29)
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Sanger |
|
Library Method
(MIGS-28)
|
|
|
Library Layout
|
|
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Library Screening Method
|
|
|
Number Of Reads
|
|
|
Read Size
|
|
|
Vector
|
|
| GC Percent |
|
| Chromosome Count |
40
|
| Plasmid Count |
0
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| ORGANISM NAME | |
|---|---|
| GOLD Organism ID |
Go0000107 |
| Organism Name |
Gallus gallus BN/SsNHsdMCW
|
| Other names (alias, synonyms, short names, common names) |
|
| Organism Domain |
EUKARYAL
|
| Phylogeny |
CHORDATA
|
| Genus |
Gallus
|
| Genus Synonyms |
|
| Species |
Gallus gallus
|
| Subspecies |
|
| Species Synonyms |
|
| Strain |
BN/SsNHsdMCW
|
| Strain Synonyms |
|
| Serovar/Cultivar |
|
| Culture Collection ID |
|
| Type Strain |
Unknown
|
| Exemplar DOI |
|
| Exemplar Name |
|
| Taxon DOI |
|
| Biosafety Level |
|
| Organism Comments |
|
| Cultured |
Yes
|
| Culture Type |
Isolate
|
| Organism Type |
Natural
|
| Uncultured Type |
|
| Commercial Strain |
|
| Commercial Strain Comments |
|
|
ORGANISM TAXONOMY
|
|
| NCBI Taxonomy ID |
9031 |
| NCBI Superkingdom |
Eukaryota
|
| NCBI Kingdom |
Metazoa
|
| NCBI Phylum |
Chordata
|
| NCBI Class |
Aves
|
| NCBI Order |
Galliformes
|
| NCBI Family |
Phasianidae
|
| NCBI Genus |
Gallus
|
| NCBI Species |
Gallus gallus
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| ISOLATION CLASSIFICATION | |
| Ecosystem |
|
| Ecosystem Category |
|
| Ecosystem Type |
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| Ecosystem Subtype |
|
| Specific Ecosystem |
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| ORGANISM EXTERNAL REFERENCES | |
| Strain Info ID |
|
| Genbank 16S ID |
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| GENERAL PROPERTIES | |
|---|---|
| Oxygen Requirement |
|
| Cell Shape |
|
| Motility |
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| Sporulation |
|
| Temperature Range |
Mesophile
|
| Salinity |
|
| pH |
|
| Cell Diameter |
|
| Cell Length |
|
| Color |
|
| Gram Staining |
|
| Biotic Relationships |
|
| Symbiotic Physical Interaction |
|
| Symbiotic Relationship |
|
| Symbiont Name |
|
| Symbiont Taxon ID |
|
| Cell Arrangements |
|
| Diseases |
|
| Known Habitats |
|
| Metabolisms |
|
| Phenotypes |
|
| Energy Sources |
|
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