Studies
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56,329 |
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Biosamples
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196,776 |
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Sequencing Projects
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525,145 |
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Analysis Projects
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385,404 |
| Organisms | 484,215 |
| PROJECT INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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GOLD Project ID
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Gp0681156
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Project Name
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Sulfuracidifex metallicus DSM 6482
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Other Names
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Legacy GOLD ID
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| NCBI BioProject Name | Sequencing of Multiple Reported Metal-Biooxidizing Members of the Extremely Thermoacidophilic Archaeal Family Sulfolobaceae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NCBI BioProject Accession
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PRJNA463410 |
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NCBI Locus Tag
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GC250
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NCBI BioSample Accession
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SAMN09933021 |
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Source Sample ID
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| PI | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Added By | JGI automated process on 2022-09-27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Last Modified By | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Project Comments |
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Project Status
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Permanent Draft
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Project Relevance
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Environmental |
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Sequencing Center
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North Carolina State University
(USA)
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Collaborating Institute
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Funding Agency
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Project Description
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Sulfuracidifex metallicus DSM 6482 genome sequencing
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| Is JGI Project |
No
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Project Information Visibility
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Public | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROJECT TYPE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Specimen
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Organism |
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Nucleic Acid
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DNA |
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Sequencing Strategy
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Whole Genome Sequencing
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| EXTERNAL PROJECT LINKS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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JGI Data Utilization Status
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JGI Award DOI
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Genome Publications
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Other Publications
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Ignored Publications
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Unassigned Publications
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| SRA Experiment |
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| PROJECT COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Study |
Sequencing of Multiple Reported Metal-Biooxidizing Members of the Extremely Thermoacidophilic Archaeal Family Sulfolobaceae |
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| Organism |
Sulfuracidifex metallicus DSM 6482 |
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| Analysis Projects |
Sulfuracidifex metallicus DSM 6482 |
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| Number of Analysis Projects (AP) |
1 |
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| Number of Derived Analyis Projects (DAP) |
0
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| SEQUENCING INFORMATION | |
|---|---|
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Sequencing Status
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Complete |
| Sequencing Quality (MIGS-31) |
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Finishing Goal
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|
Contamination Screening Input
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|
DNA Amplification Method
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|
Single Cell Lysis Protocol
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|
Single Cell Lysis Approach
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|
Sequencing Comments
|
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|
DNA Amplification Kit
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|
Sequencing Technology
(MIGS-29)
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PacBio RS II |
|
Library Method
(MIGS-28)
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|
Library Layout
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|
Library Screening Method
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|
Number Of Reads
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Read Size
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|
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Vector
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| GC Percent |
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| Chromosome Count |
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| Plasmid Count |
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| ORGANISM NAME | |
|---|---|
| GOLD Organism ID |
Go0623249 |
| Organism Name |
Sulfuracidifex metallicus DSM 6482
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| Other names (alias, synonyms, short names, common names) |
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| Organism Domain |
ARCHAEAL
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| Phylogeny |
THERMOPROTEOTA
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| Genus |
Sulfuracidifex
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| Genus Synonyms |
|
| Species |
Sulfuracidifex metallicus
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| Subspecies |
|
| Species Synonyms |
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| Strain |
DSM 6482
|
| Strain Synonyms |
|
| Serovar/Cultivar |
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| Culture Collection ID |
DSM 6482
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| Type Strain |
Yes
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| Exemplar DOI |
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| Exemplar Name |
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| Taxon DOI |
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| Biosafety Level |
|
| Organism Comments |
|
| Cultured |
Yes
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| Culture Type |
Isolate
|
| Organism Type |
Natural
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| Uncultured Type |
|
| Commercial Strain |
|
| Commercial Strain Comments |
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ORGANISM TAXONOMY
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| NCBI Taxonomy ID |
47303 |
| NCBI Superkingdom |
Archaea
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| NCBI Kingdom |
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| NCBI Phylum |
Thermoproteota
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| NCBI Class |
Thermoprotei
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| NCBI Order |
Sulfolobales
|
| NCBI Family |
Sulfolobaceae
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| NCBI Genus |
Sulfuracidifex
|
| NCBI Species |
Sulfuracidifex metallicus
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| ISOLATION CLASSIFICATION | |
| Ecosystem |
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| Ecosystem Category |
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| Ecosystem Type |
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| Ecosystem Subtype |
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| Specific Ecosystem |
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| ORGANISM EXTERNAL REFERENCES | |
| Strain Info ID |
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| Genbank 16S ID |
X90479 |
| GENERAL PROPERTIES | |
|---|---|
| Oxygen Requirement |
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| Cell Shape |
|
| Motility |
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| Sporulation |
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| Temperature Range |
Thermophile
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| Salinity |
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| pH |
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| Cell Diameter |
|
| Cell Length |
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| Color |
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| Gram Staining |
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| Biotic Relationships |
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| Symbiotic Physical Interaction |
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| Symbiotic Relationship |
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| Symbiont Name |
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| Symbiont Taxon ID |
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| Cell Arrangements |
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| Diseases |
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| Known Habitats |
|
| Metabolisms |
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| Phenotypes |
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| Energy Sources |
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