PROJECT INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
GOLD Project ID
![]() |
Gp0657885
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Project Name
![]() |
Psychrobacter cryohalolentis K5
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Names
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Legacy GOLD ID
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI BioProject Name | Psychrobacter growth screen and comparative genomics | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI BioProject Accession
![]() |
PRJEB40380 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI Locus Tag
![]() |
JMW17
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI BioSample Accession
![]() |
SAMEA7339719 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source Sample ID
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PI | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Added By | JGI automated process on 2022-06-29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified By | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Project Comments |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Project Status
![]() |
Permanent Draft
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Project Relevance
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequencing Center
![]() |
Max Planck Institute for Developmental Biology
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Collaborating Institute
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Funding Agency
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Project Description
![]() |
Psychrobacter cryohalolentis K5 genome sequencing
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Is JGI Project |
No
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Project Information Visibility
![]() |
Public | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PROJECT TYPE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Specimen
![]() |
Organism |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Nucleic Acid
![]() |
DNA |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequencing Strategy
![]() |
Whole Genome Sequencing
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EXTERNAL PROJECT LINKS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
JGI Data Utilization Status
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
JGI Award DOI
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome Publications
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Publications
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ignored Publications
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unassigned Publications
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SRA Experiment |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PROJECT COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Study |
Psychrophilic species of the genus Psychrobacter are likely descendants of pathobionts |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism |
Psychrobacter cryohalolentis K5 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Analysis Projects |
Psychrobacter cryohalolentis K5 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Analysis Projects (AP) |
1 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Derived Analyis Projects (DAP) |
0
|
SEQUENCING INFORMATION | |
---|---|
Sequencing Status
![]() |
Complete |
Sequencing Quality (MIGS-31) |
|
Finishing Goal
![]() |
|
Contamination Screening Input
![]() |
|
DNA Amplification Method
![]() |
|
Single Cell Lysis Protocol
![]() |
|
Single Cell Lysis Approach
![]() |
|
Sequencing Comments
![]() |
|
DNA Amplification Kit
![]() |
|
Sequencing Technology
(MIGS-29)
![]() |
|
Library Method
(MIGS-28)
![]() |
|
Library Layout
![]() |
|
Library Screening Method
![]() |
|
Number Of Reads
![]() |
|
Read Size
![]() |
|
Vector
![]() |
|
GC Percent |
|
Chromosome Count |
|
Plasmid Count |
|
ORGANISM NAME | |
---|---|
GOLD Organism ID |
Go0000359 |
Organism Name |
Psychrobacter cryohalolentis K5
|
Other names (alias, synonyms, short names, common names) |
|
Organism Domain |
BACTERIAL
|
Phylogeny |
PROTEOBACTERIA-GAMMA
|
Genus |
Psychrobacter
|
Genus Synonyms |
|
Species |
Psychrobacter cryohalolentis
|
Subspecies |
|
Species Synonyms |
cryopegella
|
Strain |
K5
|
Strain Synonyms |
|
Serovar/Cultivar |
|
Culture Collection ID |
DSM 17306
|
Type Strain |
Yes
|
Exemplar DOI |
10.1601/ex.10106
|
Exemplar Name |
Psychrobacter cryohalolentis
|
Taxon DOI |
10.1601/tx.10106
|
Biosafety Level |
|
Organism Comments |
|
Cultured |
Yes
|
Culture Type |
Isolate
|
Organism Type |
Natural
|
Uncultured Type |
|
Commercial Strain |
|
Commercial Strain Comments |
|
ORGANISM TAXONOMY
![]() |
|
NCBI Taxonomy ID |
335284 |
NCBI Superkingdom |
Bacteria
|
NCBI Kingdom |
|
NCBI Phylum |
Pseudomonadota
|
NCBI Class |
Gammaproteobacteria
|
NCBI Order |
Moraxellales
|
NCBI Family |
Moraxellaceae
|
NCBI Genus |
Psychrobacter
|
NCBI Species |
Psychrobacter cryohalolentis
|
ISOLATION CLASSIFICATION | |
Ecosystem |
Environmental
|
Ecosystem Category |
Aquatic
|
Ecosystem Type |
Non-marine Saline and Alkaline
|
Ecosystem Subtype |
Saline
|
Specific Ecosystem |
Unclassified
|
ORGANISM EXTERNAL REFERENCES | |
Strain Info ID |
690313 |
Genbank 16S ID |
AY660685 |
GENERAL PROPERTIES | |
---|---|
Oxygen Requirement |
Aerobe
|
Cell Shape |
Rod-shaped
|
Motility |
Nonmotile
|
Sporulation |
|
Temperature Range |
Psychrophile
|
Salinity |
Halotolerant
|
pH |
|
Cell Diameter |
|
Cell Length |
|
Color |
|
Gram Staining |
Gram-
|
Biotic Relationships | Free living |
Symbiotic Physical Interaction |
|
Symbiotic Relationship |
|
Symbiont Name |
|
Symbiont Taxon ID |
|
Cell Arrangements |
Pairs |
Diseases |
None |
Known Habitats |
Fresh water |
Metabolisms |
|
Phenotypes |
Radiation resistant |
Energy Sources |
|
You are going to add the following user to your project, biosample and study.
Contact Name/Email: Do you want to continue?
You are going to remove permissions for the following user to your project, biosample and study.
Contact Name/Email: Do you want to continue?
Changing the SP visibility will also change visibility on the following items:
Do you want to continue with this visibility change?
Checking that this Sequencing Project can be made private:
Do you want to continue with this visibility change?
Changing the SP Sequencing Strategy will also effect these items:
Do you want to continue with this Sequencing Strategy change?