Studies
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56,016 |
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Biosamples
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183,991 |
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Sequencing Projects
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508,008 |
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Analysis Projects
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381,500 |
| Organisms | 480,461 |
| PROJECT INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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GOLD Project ID
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Gp0657885
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Project Name
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Psychrobacter cryohalolentis K5
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Other Names
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Legacy GOLD ID
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| NCBI BioProject Name | Psychrobacter growth screen and comparative genomics | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NCBI BioProject Accession
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PRJEB40380 |
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NCBI Locus Tag
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JMW17
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NCBI BioSample Accession
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SAMEA7339719 |
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Source Sample ID
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| PI | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Added By | JGI automated process on 2022-06-29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Last Modified By | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Project Comments |
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Project Status
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Permanent Draft
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Project Relevance
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Sequencing Center
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Max Planck Institute for Developmental Biology
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Collaborating Institute
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Funding Agency
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Project Description
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Psychrobacter cryohalolentis K5 genome sequencing
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| Is JGI Project |
No
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Project Information Visibility
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Public | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROJECT TYPE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Specimen
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Organism |
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Nucleic Acid
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DNA |
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Sequencing Strategy
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Whole Genome Sequencing
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| EXTERNAL PROJECT LINKS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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JGI Data Utilization Status
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JGI Award DOI
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Genome Publications
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Other Publications
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Ignored Publications
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Unassigned Publications
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| SRA Experiment |
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| PROJECT COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Study |
Psychrophilic species of the genus Psychrobacter are likely descendants of pathobionts |
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| Organism |
Psychrobacter cryohalolentis K5 |
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| Analysis Projects |
Psychrobacter cryohalolentis K5 |
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| Number of Analysis Projects (AP) |
1 |
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| Number of Derived Analyis Projects (DAP) |
0
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| SEQUENCING INFORMATION | |
|---|---|
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Sequencing Status
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Complete |
| Sequencing Quality (MIGS-31) |
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Finishing Goal
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|
Contamination Screening Input
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DNA Amplification Method
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Single Cell Lysis Protocol
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|
Single Cell Lysis Approach
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|
Sequencing Comments
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DNA Amplification Kit
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|
Sequencing Technology
(MIGS-29)
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|
Library Method
(MIGS-28)
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|
Library Layout
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Library Screening Method
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Number Of Reads
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Read Size
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Vector
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| GC Percent |
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| Chromosome Count |
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| Plasmid Count |
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| ORGANISM NAME | |
|---|---|
| GOLD Organism ID |
Go0000359 |
| Organism Name |
Psychrobacter cryohalolentis K5
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| Other names (alias, synonyms, short names, common names) |
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| Organism Domain |
BACTERIAL
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| Phylogeny |
PROTEOBACTERIA-GAMMA
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| Genus |
Psychrobacter
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| Genus Synonyms |
|
| Species |
Psychrobacter cryohalolentis
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| Subspecies |
|
| Species Synonyms |
cryopegella
|
| Strain |
K5
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| Strain Synonyms |
|
| Serovar/Cultivar |
|
| Culture Collection ID |
DSM 17306
|
| Type Strain |
Yes
|
| Exemplar DOI |
10.1601/ex.10106
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| Exemplar Name |
Psychrobacter cryohalolentis
|
| Taxon DOI |
10.1601/tx.10106
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| Biosafety Level |
|
| Organism Comments |
|
| Cultured |
Yes
|
| Culture Type |
Isolate
|
| Organism Type |
Natural
|
| Uncultured Type |
|
| Commercial Strain |
|
| Commercial Strain Comments |
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ORGANISM TAXONOMY
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| NCBI Taxonomy ID |
335284 |
| NCBI Superkingdom |
Bacteria
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| NCBI Kingdom |
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| NCBI Phylum |
Pseudomonadota
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| NCBI Class |
Gammaproteobacteria
|
| NCBI Order |
Moraxellales
|
| NCBI Family |
Moraxellaceae
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| NCBI Genus |
Psychrobacter
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| NCBI Species |
Psychrobacter cryohalolentis
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| ISOLATION CLASSIFICATION | |
| Ecosystem |
Environmental
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| Ecosystem Category |
Aquatic
|
| Ecosystem Type |
Non-marine Saline and Alkaline
|
| Ecosystem Subtype |
Saline
|
| Specific Ecosystem |
Unclassified
|
| ORGANISM EXTERNAL REFERENCES | |
| Strain Info ID |
690313 |
| Genbank 16S ID |
AY660685 |
| GENERAL PROPERTIES | |
|---|---|
| Oxygen Requirement |
Aerobe
|
| Cell Shape |
Rod-shaped
|
| Motility |
Nonmotile
|
| Sporulation |
|
| Temperature Range |
Psychrophile
|
| Salinity |
Halotolerant
|
| pH |
|
| Cell Diameter |
|
| Cell Length |
|
| Color |
|
| Gram Staining |
Gram-
|
| Biotic Relationships | Free living |
| Symbiotic Physical Interaction |
|
| Symbiotic Relationship |
|
| Symbiont Name |
|
| Symbiont Taxon ID |
|
| Cell Arrangements |
Pairs |
| Diseases |
None |
| Known Habitats |
Fresh water |
| Metabolisms |
|
| Phenotypes |
Radiation resistant |
| Energy Sources |
|
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