PROJECT INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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GOLD Project ID
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Gp0396273
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Project Name
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Marine pelagic microbial communities from Tasman Sea - 102.100.100/21739
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Other Names
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Legacy GOLD ID
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NCBI BioProject Name | Metagenome from Australian marine benthic and pelagic environments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI BioProject ID
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385736 |
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NCBI BioProject Accession
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PRJNA385736 |
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NCBI Locus Tag
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NCBI BioSample Accession
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SAMN07483597 |
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PI | Andrew Bissett | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Added By |
JGI automated process
on 2019-02-04 |
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Last Modified By | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Project Comments |
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Project Status
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Permanent Draft
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Project Relevance
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Environmental |
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Sequencing Center
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Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation (CSIRO)
(Australia)
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Collaborating Institute
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Funding Agency
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Project Description
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Marine pelagic microbial communities from Tasman Sea
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Is JGI Project |
No
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Project Information Visibility
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Public | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PROJECT TYPE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Specimen
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Biome |
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Nucleic Acid
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DNA |
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Sequencing Strategy
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Metagenome
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EXTERNAL PROJECT LINKS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Project Information
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Database
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Genome Publications
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Other Publications
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SRA Experiment |
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PROJECT COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Study |
Marine microbial communities from benthic and pelagic environments in Australia |
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Biosample |
Marine pelagic microbial communities from Tasman Sea - 102.100.100/21739 |
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Analysis Projects |
Combined Assembly of marine microbial communities from pelagic environments in Australia Marine pelagic microbial communities from Tasman Sea - 102.100.100/21739 |
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Number of Analysis Projects (AP) |
2
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Number of Derived Analyis Projects (DAP) |
3
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SEQUENCING INFORMATION | |
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Sequencing Status
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Complete |
Sequencing Quality (MIGS-31) |
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Finishing Goal
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Contamination Screening Input
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DNA Amplification Method
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Sorting Technology
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Sequencing Comments
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DNA Amplification Kit
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Sequencing Technology
(MIGS-29)
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Illumina HiSeq 2500 |
Library Method
(MIGS-28)
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Library Layout
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Library Screening Method
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Number Of Reads
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Read Size
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Vector
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GC Percent |
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Chromosome Count |
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Plasmid Count |
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SAMPLE NAME | |
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Sample Name |
Marine pelagic microbial communities from Tasman Sea - 102.100.100/21739 |
Other Names (alias, synonyms, short names) |
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Sample Description |
Marine pelagic microbial communities from Tasman Sea
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SAMPLE TAXONOMY | |
NCBI Taxonomy ID |
408172 |
GOLD CLASSIFICATION | |
Ecosystem |
Environmental
|
Ecosystem Category |
Aquatic
|
Ecosystem Type |
Marine
|
Ecosystem Subtype |
Epipelagic
|
Specific Ecosystem |
|
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