PROJECT INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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GOLD Project ID
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Gp0143968
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Project Name
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Tepidibacillus decaturensis Z9
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Other Names
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Legacy GOLD ID
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NCBI BioProject Name | Tepidibacillus decaturensis strain:Z9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI BioProject Accession
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PRJNA224771 |
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NCBI Locus Tag
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U473
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NCBI BioSample Accession
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SAMN04479994 |
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PI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Added By |
JGI automated process
on 2016-05-18 |
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Last Modified By |
Hema Katta
on 2017-11-03 |
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Project Comments |
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Project Status
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Permanent Draft
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Project Relevance
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Environmental |
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Sequencing Center
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University of Illinois, Urbana-Champaign
(USA)
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Collaborating Institute
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Funding Agency
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Project Description
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Vulcanibacillus sp strain Z9
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Is JGI Project |
No
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Project Information Visibility
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Public | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PROJECT TYPE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Specimen
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Organism |
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Nucleic Acid
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DNA |
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Sequencing Strategy
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Whole Genome Sequencing
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EXTERNAL PROJECT LINKS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
JGI Data Utilization Status
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JGI Award DOI
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Genome Publications
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Genome announcements
Draft Genome Sequence of Tepidibacillus decaturensis Strain Z9, an Anaerobic, Moderately Thermophilic, and Heterotrophic Bacterium from the Deep Subsurface of the Illinois Basin, USA.
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Other Publications
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Ignored Publications
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Unassigned Publications
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SRA Experiment |
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PROJECT COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Study |
Tepidibacillus decaturensis Z9 Genome sequencing |
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Organism |
Tepidibacillus decaturensis Z9 |
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Analysis Projects |
Tepidibacillus decaturensis Z9 |
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Number of Analysis Projects (AP) |
1 |
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Number of Derived Analyis Projects (DAP) |
0
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SEQUENCING INFORMATION | |
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Sequencing Status
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Complete |
Sequencing Quality (MIGS-31) |
Level 1: Standard Draft |
Finishing Goal
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Contamination Screening Input
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DNA Amplification Method
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Single Cell Lysis Protocol
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Single Cell Lysis Approach
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Sequencing Comments
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DNA Amplification Kit
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Sequencing Technology
(MIGS-29)
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454 Illumina HiSeq |
Library Method
(MIGS-28)
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Library Layout
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Library Screening Method
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Number Of Reads
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Read Size
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Vector
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GC Percent |
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Chromosome Count |
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Plasmid Count |
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ORGANISM NAME | |
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GOLD Organism ID |
Go0138911 |
Organism Name |
Tepidibacillus decaturensis Z9
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Other names (alias, synonyms, short names, common names) |
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Organism Domain |
BACTERIAL
|
Phylogeny |
FIRMICUTES
|
Genus |
Tepidibacillus
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Genus Synonyms |
|
Species |
Tepidibacillus decaturensis
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Subspecies |
|
Species Synonyms |
|
Strain |
Z9
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Strain Synonyms |
|
Serovar/Cultivar |
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Culture Collection ID |
ATCC BAA-2644
|
Type Strain |
Yes
|
Exemplar DOI |
10.1601/ex.29046
|
Exemplar Name |
Tepidibacillus decaturensis
|
Taxon DOI |
10.1601/tx.29046
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Biosafety Level |
|
Organism Comments |
|
Cultured |
Yes
|
Culture Type |
Isolate
|
Organism Type |
Natural
|
Uncultured Type |
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Commercial Strain |
|
Commercial Strain Comments |
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ORGANISM TAXONOMY
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NCBI Taxonomy ID |
1413211 |
NCBI Superkingdom |
Bacteria
|
NCBI Kingdom |
|
NCBI Phylum |
Firmicutes
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NCBI Class |
Bacilli
|
NCBI Order |
Bacillales
|
NCBI Family |
Bacillaceae
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NCBI Genus |
Tepidibacillus
|
NCBI Species |
Tepidibacillus decaturensis
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ISOLATION CLASSIFICATION | |
Ecosystem |
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Ecosystem Category |
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Ecosystem Type |
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Ecosystem Subtype |
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Specific Ecosystem |
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ORGANISM EXTERNAL REFERENCES | |
Strain Info ID |
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Genbank 16S ID |
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GENERAL PROPERTIES | |
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Oxygen Requirement |
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Cell Shape |
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Motility |
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Sporulation |
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Temperature Range |
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Salinity |
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pH |
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Cell Diameter |
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Cell Length |
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Color |
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Gram Staining |
Gram+
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Biotic Relationships |
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Symbiotic Physical Interaction |
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Symbiotic Relationship |
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Symbiont Name |
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Symbiont Taxon ID |
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Cell Arrangements |
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Diseases |
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Known Habitats |
|
Metabolisms |
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Phenotypes |
|
Energy Sources |
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