PROJECT INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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GOLD Project ID
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Gp0037079
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Project Name
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Anopheles epiroticus
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Other Names
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Legacy ER Project ID
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43491
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Legacy GOLD ID
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Gi0043491
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NCBI BioProject Name | Anopheles epiroticus strain:epiroticus2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI BioProject Accession
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PRJNA191562 |
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NCBI Locus Tag
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NCBI BioSample Accession
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SAMN01087920 |
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PI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Added By |
JGI automated process
on 2013-04-02 |
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Last Modified By |
Supratim Mukherjee
on 2017-03-29 |
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Project Comments |
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Project Status
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Permanent Draft
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Project Relevance
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Medical |
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Sequencing Center
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Broad Institute
(USA)
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Collaborating Institute
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Funding Agency
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Project Description
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Is JGI Project |
No
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Project Information Visibility
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Public | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PROJECT TYPE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Specimen
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Organism |
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Nucleic Acid
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DNA |
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Sequencing Strategy
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Whole Genome Sequencing
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EXTERNAL PROJECT LINKS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
JGI Data Utilization Status
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JGI Award DOI
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Genome Publications
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Other Publications
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Ignored Publications
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Unassigned Publications
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SRA Experiment |
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PROJECT COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Study |
Anopheles Genome sequencing project - Broad institute |
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Organism |
Anopheles epiroticus |
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Analysis Projects |
Anopheles epiroticus |
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Number of Analysis Projects (AP) |
1 |
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Number of Derived Analyis Projects (DAP) |
0
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SEQUENCING INFORMATION | |
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Sequencing Status
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Complete |
Sequencing Quality (MIGS-31) |
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Finishing Goal
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Contamination Screening Input
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DNA Amplification Method
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Single Cell Lysis Protocol
![]() |
|
Single Cell Lysis Approach
![]() |
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Sequencing Comments
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|
DNA Amplification Kit
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Sequencing Technology
(MIGS-29)
![]() |
Illumina |
Library Method
(MIGS-28)
![]() |
|
Library Layout
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Library Screening Method
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|
Number Of Reads
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Read Size
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Vector
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GC Percent |
|
Chromosome Count |
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Plasmid Count |
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ORGANISM NAME | |
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GOLD Organism ID |
Go0037078 |
Organism Name |
Anopheles epiroticus
|
Other names (alias, synonyms, short names, common names) |
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Organism Domain |
EUKARYAL
|
Phylogeny |
ARTHROPODA
|
Genus |
Anopheles
|
Genus Synonyms |
|
Species |
Anopheles epiroticus
|
Subspecies |
|
Species Synonyms |
|
Strain |
|
Strain Synonyms |
|
Serovar/Cultivar |
|
Culture Collection ID |
|
Type Strain |
Unknown
|
Exemplar DOI |
|
Exemplar Name |
|
Taxon DOI |
|
Biosafety Level |
|
Organism Comments |
|
Cultured |
Yes
|
Culture Type |
Isolate
|
Organism Type |
Natural
|
Uncultured Type |
|
Commercial Strain |
|
Commercial Strain Comments |
|
ORGANISM TAXONOMY
![]() |
|
NCBI Taxonomy ID |
199890 |
NCBI Superkingdom |
Eukaryota
|
NCBI Kingdom |
Metazoa
|
NCBI Phylum |
Arthropoda
|
NCBI Class |
Insecta
|
NCBI Order |
Diptera
|
NCBI Family |
Culicidae
|
NCBI Genus |
Anopheles
|
NCBI Species |
Anopheles epiroticus
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ISOLATION CLASSIFICATION | |
Ecosystem |
|
Ecosystem Category |
|
Ecosystem Type |
|
Ecosystem Subtype |
|
Specific Ecosystem |
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ORGANISM EXTERNAL REFERENCES | |
Strain Info ID |
|
Genbank 16S ID |
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GENERAL PROPERTIES | |
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Oxygen Requirement |
|
Cell Shape |
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Motility |
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Sporulation |
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Temperature Range |
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Salinity |
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pH |
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Cell Diameter |
|
Cell Length |
|
Color |
|
Gram Staining |
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Biotic Relationships |
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Symbiotic Physical Interaction |
|
Symbiotic Relationship |
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Symbiont Name |
|
Symbiont Taxon ID |
|
Cell Arrangements |
|
Diseases |
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Known Habitats |
|
Metabolisms |
|
Phenotypes |
|
Energy Sources |
|
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