Studies
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53,486 |
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Biosamples
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170,233 |
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Sequencing Projects
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475,940 |
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Analysis Projects
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360,451 |
| Organisms | 463,499 |
| PROJECT INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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GOLD Project ID
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Gp0034173
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Project Name
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Acinetobacter junii CIP 107470
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Other Names
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Legacy ER Project ID
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39046
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Legacy GOLD ID
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Gi22777
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| NCBI BioProject Name | Acinetobacter junii CIP 107470 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NCBI BioProject Accession
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PRJNA183291 |
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NCBI Locus Tag
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F953
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NCBI BioSample Accession
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SAMN01087850 |
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| PI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Added By |
JGI automated process
on 2012-12-17 |
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| Last Modified By |
JGI automated process
on 2014-05-20 |
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| Project Comments |
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Project Status
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Permanent Draft
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Project Relevance
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Sequencing Center
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Broad Institute
(USA)
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Collaborating Institute
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Funding Agency
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Project Description
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Acinetobacter Sequencing
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| Is JGI Project |
No
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Project Information Visibility
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Public | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROJECT TYPE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Specimen
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Organism |
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Nucleic Acid
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DNA |
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Sequencing Strategy
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Whole Genome Sequencing
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| EXTERNAL PROJECT LINKS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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JGI Data Utilization Status
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JGI Award DOI
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Genome Publications
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Other Publications
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Ignored Publications
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Unassigned Publications
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| SRA Experiment |
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| PROJECT COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Study |
Acinetobacter Sequencing- Broad Institute |
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| Organism |
Acinetobacter junii CIP 107470 |
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| Analysis Projects |
Acinetobacter junii CIP 107470 |
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| Number of Analysis Projects (AP) |
1 |
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| Number of Derived Analyis Projects (DAP) |
0
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| SEQUENCING INFORMATION | |
|---|---|
|
Sequencing Status
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Complete |
| Sequencing Quality (MIGS-31) |
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|
Finishing Goal
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|
Contamination Screening Input
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DNA Amplification Method
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|
Single Cell Lysis Protocol
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|
Single Cell Lysis Approach
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|
Sequencing Comments
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|
DNA Amplification Kit
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|
Sequencing Technology
(MIGS-29)
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Illumina |
|
Library Method
(MIGS-28)
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|
Library Layout
|
|
|
Library Screening Method
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Number Of Reads
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|
Read Size
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Vector
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| GC Percent |
38
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| Chromosome Count |
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| Plasmid Count |
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| ORGANISM NAME | |
|---|---|
| GOLD Organism ID |
Go0034173 |
| Organism Name |
Acinetobacter junii CIP 107470
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| Other names (alias, synonyms, short names, common names) |
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| Organism Domain |
BACTERIAL
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| Phylogeny |
PROTEOBACTERIA-GAMMA
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| Genus |
Acinetobacter
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| Genus Synonyms |
|
| Species |
Acinetobacter junii
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| Subspecies |
|
| Species Synonyms |
|
| Strain |
CIP 107470
|
| Strain Synonyms |
|
| Serovar/Cultivar |
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| Culture Collection ID |
MTCC 11364
|
| Type Strain |
Yes
|
| Exemplar DOI |
10.1601/ex.2771
|
| Exemplar Name |
Acinetobacter grimontii CIP 107470
|
| Taxon DOI |
10.1601/tx.2771
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| Biosafety Level |
2
|
| Organism Comments |
|
| Cultured |
Yes
|
| Culture Type |
Isolate
|
| Organism Type |
Natural
|
| Uncultured Type |
|
| Commercial Strain |
|
| Commercial Strain Comments |
|
|
ORGANISM TAXONOMY
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| NCBI Taxonomy ID |
1217666 |
| NCBI Superkingdom |
Bacteria
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| NCBI Kingdom |
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| NCBI Phylum |
Proteobacteria
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| NCBI Class |
Gammaproteobacteria
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| NCBI Order |
Moraxellales
|
| NCBI Family |
Moraxellaceae
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| NCBI Genus |
Acinetobacter
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| NCBI Species |
Acinetobacter junii
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| ISOLATION CLASSIFICATION | |
| Ecosystem |
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| Ecosystem Category |
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| Ecosystem Type |
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| Ecosystem Subtype |
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| Specific Ecosystem |
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| ORGANISM EXTERNAL REFERENCES | |
| Strain Info ID |
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| Genbank 16S ID |
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| GENERAL PROPERTIES | |
|---|---|
| Oxygen Requirement |
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| Cell Shape |
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| Motility |
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| Sporulation |
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| Temperature Range |
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| Salinity |
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| pH |
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| Cell Diameter |
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| Cell Length |
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| Color |
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| Gram Staining |
Gram-
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| Biotic Relationships |
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| Symbiotic Physical Interaction |
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| Symbiotic Relationship |
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| Symbiont Name |
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| Symbiont Taxon ID |
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| Cell Arrangements |
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| Diseases |
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| Known Habitats |
Host |
| Metabolisms |
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| Phenotypes |
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| Energy Sources |
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| CYANOBACTERIA METADATA | |
| Filaments |
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| Filament Type |
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| Differentiated Cells |
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| Position Of Heterocysts |
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| Cysts |
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| Mode Of Reproduction |
|
| Trichome |
|
| Trichome Type |
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| Carotenoids |
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| Pigments |
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| Phage Infectivity |
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| Phage Type |
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| Restriction Enzyme |
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| Toxin Production |
|
| Toxin Type |
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| Secondary Metabolites |
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| Developmental Cycle |
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| Branching |
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| Gas Vesicles |
|
| Gas Vesicle Type |
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| Diagnostic Inclusion Body Information |
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| Extracellular Structures |
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| Bloom Forming |
|
| Pigment Type |
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| Complementary chromatic adaptation (CCA) |
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| Medium Types |
|
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