ANALYSIS PROJECT INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
GOLD Analysis Project ID
![]() |
Ga0523459 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Analysis Project Name |
Klebsiella pneumoniae FDAARGOS_1327 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Analysis Project Name Suffix
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Analysis Project Type
![]() |
Genome Analysis (Isolate) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMG Submission ID
![]() |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Completion Status |
Incomplete |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMG Completion Date
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Analysis Project Description
![]() |
Submitting a public genome from NCBI/GenBank to IMG for analysis. |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Visibility | Public | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ANALYSIS PROJECT METADATA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Assembly Method
(MIGS-30)
![]() |
SMRT v. 8.0.0, HGAP v. 4 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMG Decontamination
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMG Decontamination Method
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Scaffold Count
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Contig Count
![]() |
12 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Calling Method
(MIGS-32)
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Count |
5456 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Estimated Size |
5500000 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequencing Depth
(MIGS-31.1)
![]() |
763.24x |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Anomalous Assembly |
No |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Anomalous Reason |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Annotation Pipeline |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Added By |
JGI automated process
on 2021-12-24 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified By | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ORF Comparison Tools
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PROJECT EXTERNAL REFERENCES | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMG Taxon ID
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Accession
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Release Date |
2021-02-22 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ANALYSIS PROJECT COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Study |
Genome sequencing as part of FDA-ARGOS: dAtabase for Regulatory Grade micrObial Sequences project |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Studies
![]() |
1 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Projects
![]() |
1 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Related Analysis Projects
![]() |
0 |
You are going to add the following user to your analysis project, project, biosample and study.
Contact Name/Email: Do you want to continue?
You are going to remove permissions for the following user to your analysis project, project, biosample and study.
Contact Name/Email: Do you want to continue?
Changing the AP visibility will also change visibility on the following items:
Do you want to continue with this visibility change?
Changing the AP visibility will also change downgrade visibility on the following items:
Do you want to continue with this visibility change?