ANALYSIS PROJECT INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
GOLD Analysis Project ID
![]() |
Ga0483761 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Analysis Project Name Prefix |
Citrobacter sp. RHBSTW-00696 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Analysis Project Name Suffix
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Analysis Project Type
![]() |
Genome Analysis (Isolate) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMG Submission ID
![]() |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Completion Status |
Incomplete |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMG Completion Date
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PI Name |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Analysis Project Description
![]() |
Submitting a public genome from NCBI/GenBank to IMG for analysis. |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Visibility | Public | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ANALYSIS PROJECT METADATA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Assembly Method
(MIGS-30)
![]() |
Unicycler v. v0.4.7 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMG Decontamination
![]() |
No |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMG Decontamination Method
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Scaffold Count
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Contig Count
![]() |
7 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Calling Method
(MIGS-32)
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Count |
5660 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Estimated Size |
5780000 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequencing Depth
(MIGS-31.1)
![]() |
73.1206555606231x |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Annotation Pipeline |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Added By |
JGI automated process
on 2021-01-06 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified By | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ORF Comparison Tools
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16S Recovered
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16S Recovery Software
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PROJECT EXTERNAL REFERENCES | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMG Taxon ID
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Accession
![]() |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Assembly Accession |
GCA_013733095.1 GCA_013733095.1 GCA_013733095.1 GCA_013733095.1 GCA_013733095.1 GCA_013733095.1 GCA_013733095.1 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Release Date |
2020-09-30 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ANALYSIS PROJECT COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Study |
The environmental REsistome: confluence of Human and Animal Biota in antibiotic resistance spread (REHAB) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Studies
![]() |
1 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Projects
![]() |
1 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Related Analysis Projects
![]() |
0 |
You are going to add the following user to your analysis project, project, biosample and study.
Contact Name/Email: Do you want to continue?
You are going to remove permissions for the following user to your analysis project, project, biosample and study.
Contact Name/Email: Do you want to continue?
Changing the AP visibility will also change visibility on the following items:
Do you want to continue with this visibility change?
Changing the AP visibility will also change downgrade visibility on the following items:
Do you want to continue with this visibility change?