ANALYSIS PROJECT INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||
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GOLD Analysis Project ID
![]() |
Ga0263400 |
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Analysis Project Name |
Leptolyngbya boryana NIES-2135 |
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Analysis Project Name Suffix
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Analysis Project Type
![]() |
Genome Analysis (Isolate) |
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IMG Submission ID
![]() |
204134 | ||||||||||||||||||||||||
Completion Status |
Complete |
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IMG Completion Date
![]() |
2018-12-05 |
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PI | |||||||||||||||||||||||||
Analysis Project Description
![]() |
Submitting a public genome from NCBI/GenBank to IMG for analysis. |
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Visibility | Public | ||||||||||||||||||||||||
ANALYSIS PROJECT METADATA | |||||||||||||||||||||||||
Assembly Method
(MIGS-30)
![]() |
GS De Novo Assembler v. 2.9 |
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IMG Decontamination
![]() |
Yes |
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IMG Decontamination Method
![]() |
PhiX decontamination |
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Scaffold Count
![]() |
4 |
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Contig Count
![]() |
4 |
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Gene Calling Method
(MIGS-32)
![]() |
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Gene Count |
6699 |
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Estimated Size |
7233668 |
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Sequencing Depth
(MIGS-31.1)
![]() |
59x |
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Genbank Anomalous Assembly |
No |
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Genbank Anomalous Reason |
|
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Annotation Pipeline |
IMG Annotation Pipeline v.4.16.6 |
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Added By |
JGI automated process
on 2018-03-14 |
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Last Modified By |
JGI automated process
on 2018-12-17 |
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ORF Comparison Tools
![]() |
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PROJECT EXTERNAL REFERENCES | |||||||||||||||||||||||||
IMG Taxon ID
![]() |
2811995071 |
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Genbank Accession
![]() |
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Genbank Release Date |
2017-09-29 |
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ANALYSIS PROJECT COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||
Study |
Genome Sequencing Project of the NIES cyanobacteria collection 2016 |
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Number of Studies
![]() |
1 |
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Number of Projects
![]() |
1 |
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Number of Related Analysis Projects
![]() |
0 |
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