ANALYSIS PROJECT INFORMATION | |||||||||||||||||||||
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GOLD Analysis Project ID
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Ga0030993 |
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Analysis Project Name |
Sulfuricurvum kujiense YK-1, DSM 16994 |
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Analysis Project Name Suffix
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Analysis Project Type
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Genome Analysis (Isolate) |
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IMG Submission ID
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Completion Status |
Complete |
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IMG Completion Date
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2011-03-26 |
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PI | Jonathan Eisen | ||||||||||||||||||||
Analysis Project Description
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Visibility | Public | ||||||||||||||||||||
ANALYSIS PROJECT METADATA | |||||||||||||||||||||
Assembly Method
(MIGS-30)
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Newbler v. 2.3, Velvet v. 1.1.04, Phrap v. 4.24 SPS |
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IMG Decontamination
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No |
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IMG Decontamination Method
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Scaffold Count
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5 |
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Contig Count
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Gene Calling Method
(MIGS-32)
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Prodigal 1.4, GenePRIMP |
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Gene Count |
2879 |
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Estimated Size |
2819357 |
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Sequencing Depth
(MIGS-31.1)
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357.4x Illumina, 51.1x pyrosequence |
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Genbank Anomalous Assembly |
No |
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Genbank Anomalous Reason |
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Annotation Pipeline |
IMG/W 3.4 |
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Added By | Jonathan Eisen on 2009-08-24 | ||||||||||||||||||||
Last Modified By | JGI automated process on 2023-05-12 | ||||||||||||||||||||
ORF Comparison Tools
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PROJECT EXTERNAL REFERENCES | |||||||||||||||||||||
IMG Taxon ID
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649633097 |
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Genbank Accession
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Genbank Release Date |
2013-07-06 |
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ANALYSIS PROJECT COMPOSITION | |||||||||||||||||||||
Study |
A Genomic Encyclopedia of Bacteria and Archaea (GEBA) |
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Number of Studies
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1 |
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Number of Projects
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1 |
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Number of Related Analysis Projects
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0 |
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JGI INFORMATION | |||||||||||||||||||||
JGI Data Utilization Status
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Unrestricted |
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ITS Analysis Project ID
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1377429 (Portal) |
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ITS Analysis Project Name
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Sulfuricurvum kujiense YK-1, DSM 16994 |
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ITS Analysis Product Name
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Microbial Minimal Draft Isolate Genome |
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ITS Version Number |
1 |
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Library Names
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JGI Award DOI
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