PROJECT INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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GOLD Project ID
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Gp0086862
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Project Name
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Mucispirillum schaedleri ASF457
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Other Names
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Legacy ER Project ID
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69903
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Legacy GOLD ID
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Gi0069903
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NCBI BioProject Name | Mucispirillum schaedleri ASF457 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI BioProject Accession
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PRJNA213740 |
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NCBI Locus Tag
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N508
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NCBI BioSample Accession
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SAMN02297858 |
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Source Sample ID
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PI | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Added By | JGI automated process on 2014-02-14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified By | JGI automated process on 2014-08-18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Project Comments |
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Project Status
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Permanent Draft
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Project Relevance
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Medical |
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Sequencing Center
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Broad Institute
(USA)
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Collaborating Institute
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Funding Agency
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Project Description
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Mouse Models Colitis
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Is JGI Project |
No
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Project Information Visibility
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Public | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PROJECT TYPE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Specimen
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Organism |
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Nucleic Acid
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DNA |
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Sequencing Strategy
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Whole Genome Sequencing
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EXTERNAL PROJECT LINKS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
JGI Data Utilization Status
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JGI Award DOI
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Genome Publications
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Other Publications
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Ignored Publications
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Unassigned Publications
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Genome announcements: Draft genome sequences of the altered schaedler flora, a defined bacterial community from gnotobiotic mice. PubMed: 24723722 DOI: 10.1128/genomeA.00287-14 |
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SRA Experiment |
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PROJECT COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Study |
Mucispirillum schaedleri ASF457 |
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Organism |
Mucispirillum schaedleri ASF457 |
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Analysis Projects |
Mucispirillum schaedleri ASF457 |
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Number of Analysis Projects (AP) |
1 |
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Number of Derived Analyis Projects (DAP) |
0
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SEQUENCING INFORMATION | |
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Sequencing Status
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Complete |
Sequencing Quality (MIGS-31) |
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Finishing Goal
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|
Contamination Screening Input
![]() |
|
DNA Amplification Method
![]() |
|
Single Cell Lysis Protocol
![]() |
|
Single Cell Lysis Approach
![]() |
|
Sequencing Comments
![]() |
|
DNA Amplification Kit
![]() |
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Sequencing Technology
(MIGS-29)
![]() |
Illumina |
Library Method
(MIGS-28)
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|
Library Layout
![]() |
|
Library Screening Method
![]() |
|
Number Of Reads
![]() |
|
Read Size
![]() |
|
Vector
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|
GC Percent |
31
|
Chromosome Count |
|
Plasmid Count |
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ORGANISM NAME | |
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GOLD Organism ID |
Go0014266 |
Organism Name |
Mucispirillum schaedleri ASF457
|
Other names (alias, synonyms, short names, common names) |
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Organism Domain |
BACTERIAL
|
Phylogeny |
DEFERRIBACTERES
|
Genus |
Mucispirillum
|
Genus Synonyms |
|
Species |
Mucispirillum schaedleri
|
Subspecies |
|
Species Synonyms |
|
Strain |
ASF457
|
Strain Synonyms |
|
Serovar/Cultivar |
|
Culture Collection ID |
|
Type Strain |
No
|
Exemplar DOI |
|
Exemplar Name |
|
Taxon DOI |
|
Biosafety Level |
|
Organism Comments |
|
Cultured |
Yes
|
Culture Type |
Isolate
|
Organism Type |
Natural
|
Uncultured Type |
|
Commercial Strain |
|
Commercial Strain Comments |
|
ORGANISM TAXONOMY
![]() |
|
NCBI Taxonomy ID |
1379858 |
NCBI Superkingdom |
Bacteria
|
NCBI Kingdom |
|
NCBI Phylum |
Deferribacteres
|
NCBI Class |
Deferribacteres
|
NCBI Order |
Deferribacterales
|
NCBI Family |
Mucispirillaceae
|
NCBI Genus |
Mucispirillum
|
NCBI Species |
Mucispirillum schaedleri
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ISOLATION CLASSIFICATION | |
Ecosystem |
|
Ecosystem Category |
|
Ecosystem Type |
|
Ecosystem Subtype |
|
Specific Ecosystem |
|
ORGANISM EXTERNAL REFERENCES | |
Strain Info ID |
|
Genbank 16S ID |
|
GENERAL PROPERTIES | |
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Oxygen Requirement |
Anaerobe
|
Cell Shape |
Spiral-shaped
|
Motility |
Motile
|
Sporulation |
|
Temperature Range |
Mesophile
|
Salinity |
|
pH |
|
Cell Diameter |
|
Cell Length |
|
Color |
|
Gram Staining |
|
Biotic Relationships | Symbiotic |
Symbiotic Physical Interaction |
Endosymbiotic extracellular
|
Symbiotic Relationship |
Commensal
|
Symbiont Name |
|
Symbiont Taxon ID |
|
Cell Arrangements |
Singles |
Diseases |
None |
Known Habitats |
Host Gut Mouse Gut |
Metabolisms |
|
Phenotypes |
Nonvirulent |
Energy Sources |
Heterotroph |
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