Studies
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41,136 |
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Biosamples
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90,036 |
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Sequencing Projects
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326,759 |
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Analysis Projects
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269,302 |
| Organisms | 372,123 |
| PROJECT INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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GOLD Project ID
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Gp0041988
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Project Name
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Luteibacter sp. 9135
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Other Names
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Legacy ER Project ID
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47905
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Legacy GOLD ID
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Gi0047905
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| NCBI BioProject Name | Luteibacter sp. 9135 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NCBI BioProject ID
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247911 |
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NCBI BioProject Accession
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PRJNA247911 |
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NCBI Locus Tag
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FA89
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NCBI BioSample Accession
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SAMN02786965 |
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| PI | David A. Baltrus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Added By |
JGI automated process
on 2013-05-14 |
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| Last Modified By |
JGI automated process
on 2019-09-30 |
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| Project Comments |
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Project Status
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Permanent Draft
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Project Relevance
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Sequencing Center
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DOE Joint Genome Institute (JGI)
(USA)
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Collaborating Institute
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Funding Agency
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U.S. Department of Energy (DOE)
(USA)
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Project Description
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Convergent evolution of an endohyphal lifestyle and mutualism in phylogenetically diverse bacteria
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| Is JGI Project |
Yes
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Project Information Visibility
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Public | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROJECT TYPE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Specimen
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Organism |
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Nucleic Acid
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DNA |
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Sequencing Strategy
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Whole Genome Sequencing
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| EXTERNAL PROJECT LINKS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| JGI Portal Download | Raw Sequence Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Project Information
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Database
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Genome Publications
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Other Publications
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| SRA Experiment |
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| PROJECT COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Study |
Convergent evolution of an endohyphal lifestyle and mutualism in phylogenetically diverse bacteria |
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| Organism |
Luteibacter sp. 9135 |
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| Analysis Projects |
Luteibacter sp. 9135 |
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| Number of Analysis Projects |
1 |
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| Number of DAPs |
0
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| SEQUENCING INFORMATION | |
|---|---|
|
Sequencing Status
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Complete |
| Sequencing Quality (MIGS-31) |
Level 3: Improved-High-Quality Draft |
|
Finishing Goal
|
Level 3: Improved-High-Quality Draft |
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Sequencing Comments
|
|
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Sequencing Technology
(MIGS-29)
|
PacBio RS Illumina HiSeq 2000 PacBio RS II |
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Library Method
(MIGS-28)
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PacBio >10kb w/ AMPure Bead Size Selection, Tubes
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Number Of Reads
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Read Size
|
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Vector
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| GC Percent |
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| Chromosome Count |
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| Plasmid Count |
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| ORGANISM NAME | |
|---|---|
| GOLD Organism ID |
Go0041988 |
| Organism Name |
Luteibacter sp. 9135
|
| Other names (alias, synonyms, short names, common names) |
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| Organism Domain |
BACTERIAL
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| Phylogeny |
PROTEOBACTERIA-GAMMA
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| Genus |
Luteibacter
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| Genus Synonyms |
|
| Species |
Luteibacter sp. 9135
|
| Subspecies |
|
| Species Synonyms |
|
| Strain |
9135
|
| Strain Synonyms |
|
| Serovar/Cultivar |
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| Culture Collection ID |
|
| Type Strain |
Unknown
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| Exemplar DOI |
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| Exemplar Name |
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| Taxon DOI |
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| Biosafety Level |
|
| Organism Comments |
|
| Cultured |
Yes
|
| Culture Type |
Isolate
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| Organism Type |
Natural
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| Uncultured Type |
|
| Commercial Strain |
|
| Commercial Strain Comments |
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ORGANISM TAXONOMY
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| NCBI Taxonomy ID |
1500893 |
| NCBI Superkingdom |
Bacteria
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| NCBI Kingdom |
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| NCBI Phylum |
Proteobacteria
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| NCBI Class |
Gammaproteobacteria
|
| NCBI Order |
Xanthomonadales
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| NCBI Family |
Rhodanobacteraceae
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| NCBI Genus |
Luteibacter
|
| NCBI Species |
Luteibacter sp. 9135
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| ISOLATION CLASSIFICATION | |
| Ecosystem |
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| Ecosystem Category |
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| Ecosystem Type |
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| Ecosystem Subtype |
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| Specific Ecosystem |
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| ORGANISM EXTERNAL REFERENCES | |
| Strain Info ID |
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| Genbank 16S ID |
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| GENERAL PROPERTIES | |
|---|---|
| Oxygen Requirement |
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| Cell Shape |
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| Motility |
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| Sporulation |
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| Temperature Range |
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| Salinity |
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| pH |
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| Cell Diameter |
|
| Cell Length |
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| Color |
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| Gram Staining |
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| Biotic Relationships |
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| Symbiotic Physical Interaction |
|
| Symbiotic Relationship |
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| Symbiont Name |
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| Symbiont Taxon ID |
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| Cell Arrangements |
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| Diseases |
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| Known Habitats |
|
| Metabolisms |
|
| Phenotypes |
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| Energy Sources |
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