PROJECT INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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GOLD Project ID
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Gp0015311
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Project Name
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Persephonella lauensis IFO5_L8
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Other Names
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Legacy ER Project ID
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22036
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Legacy GOLD ID
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Gi14062
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NCBI BioProject Name | Persephonella sp. IF05-L8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI BioProject Accession
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PRJNA237257 |
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NCBI Locus Tag
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BO13
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NCBI BioSample Accession
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SAMN02841204 |
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Source Sample ID
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PI | anna-louise reysenbach | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Added By | JGI automated process on 2012-01-27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified By | JGI automated process on 2023-05-22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Project Comments |
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Project Status
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Permanent Draft
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Project Relevance
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Sequencing Center
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DOE Joint Genome Institute (JGI)
(USA)
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Collaborating Institute
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Portland State University
(USA)
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Funding Agency
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U.S. Department of Energy (DOE)
(USA)
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Project Description
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Is JGI Project |
Yes
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Project Information Visibility
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Public | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PROJECT TYPE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Specimen
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Organism |
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Nucleic Acid
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DNA |
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Sequencing Strategy
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Whole Genome Sequencing
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EXTERNAL PROJECT LINKS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
JGI Data Utilization Status
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Unrestricted
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JGI Award DOI
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10.46936/10.25585/60007379 |
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JGI Portal Download | Raw Sequence Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome Publications
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Other Publications
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Ignored Publications
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Unassigned Publications
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SRA Experiment |
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PROJECT COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Study |
Bacterial isolates from the 'uncultivated': new families, genera and species from deep-sea vents |
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Organism |
Persephonella lauensis IFO5_L8 |
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Analysis Projects |
Persephonella lauensis IFO5_L8 |
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Number of Analysis Projects (AP) |
1 |
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Number of Derived Analyis Projects (DAP) |
0
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SEQUENCING INFORMATION | |
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Sequencing Status
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Complete |
Sequencing Quality (MIGS-31) |
Level 3: Improved-High-Quality Draft |
Finishing Goal
![]() |
Level 3: Improved-High-Quality Draft |
Contamination Screening Input
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|
DNA Amplification Method
![]() |
|
Single Cell Lysis Protocol
![]() |
|
Single Cell Lysis Approach
![]() |
|
Sequencing Comments
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|
DNA Amplification Kit
![]() |
|
Sequencing Technology
(MIGS-29)
![]() |
PacBio RS II |
Library Method
(MIGS-28)
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|
Library Layout
![]() |
|
Library Screening Method
![]() |
|
Number Of Reads
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|
Read Size
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|
Vector
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|
GC Percent |
35
|
Chromosome Count |
|
Plasmid Count |
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ORGANISM NAME | |
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GOLD Organism ID |
Go0015311 |
Organism Name |
Persephonella lauensis IFO5_L8
|
Other names (alias, synonyms, short names, common names) |
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Organism Domain |
BACTERIAL
|
Phylogeny |
AQUIFICOTA
|
Genus |
Persephonella
|
Genus Synonyms |
|
Species |
Persephonella lauensis
|
Subspecies |
|
Species Synonyms |
|
Strain |
IFO5_L8
|
Strain Synonyms |
|
Serovar/Cultivar |
|
Culture Collection ID |
|
Type Strain |
Unknown
|
Exemplar DOI |
|
Exemplar Name |
|
Taxon DOI |
|
Biosafety Level |
|
Organism Comments |
|
Cultured |
Yes
|
Culture Type |
Isolate
|
Organism Type |
Natural
|
Uncultured Type |
|
Commercial Strain |
|
Commercial Strain Comments |
|
ORGANISM TAXONOMY
![]() |
|
NCBI Taxonomy ID |
1158338 |
NCBI Superkingdom |
Bacteria
|
NCBI Kingdom |
|
NCBI Phylum |
Aquificota
|
NCBI Class |
Aquificae
|
NCBI Order |
Aquificales
|
NCBI Family |
Hydrogenothermaceae
|
NCBI Genus |
Persephonella
|
NCBI Species |
Persephonella sp. IF05-L8
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ISOLATION CLASSIFICATION | |
Ecosystem |
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Ecosystem Category |
|
Ecosystem Type |
|
Ecosystem Subtype |
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Specific Ecosystem |
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ORGANISM EXTERNAL REFERENCES | |
Strain Info ID |
|
Genbank 16S ID |
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GENERAL PROPERTIES | |
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Oxygen Requirement |
|
Cell Shape |
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Motility |
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Sporulation |
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Temperature Range |
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Salinity |
|
pH |
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Cell Diameter |
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Cell Length |
|
Color |
|
Gram Staining |
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Biotic Relationships |
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Symbiotic Physical Interaction |
|
Symbiotic Relationship |
|
Symbiont Name |
|
Symbiont Taxon ID |
|
Cell Arrangements |
|
Diseases |
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Known Habitats |
|
Metabolisms |
|
Phenotypes |
|
Energy Sources |
|
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