Studies
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43,778 |
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Biosamples
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100,585 |
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Sequencing Projects
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345,923 |
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Analysis Projects
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271,186 |
| Organisms | 378,864 |
| PROJECT INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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GOLD Project ID
|
Gp0020369
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Project Name
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Enterococcus faecium H17243
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Other Names
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Legacy ER Project ID
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9462
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Legacy GOLD ID
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Gi16551
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| NCBI BioProject Name | Enterococcus faecium EnGen0149 strain:H17243 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NCBI BioProject ID
|
88317 |
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NCBI BioProject Accession
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PRJNA88317 |
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NCBI Locus Tag
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SI7
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NCBI BioSample Accession
|
SAMN00808974 |
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| PI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Added By |
JGI automated process
on 2012-04-04 |
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| Last Modified By |
JGI automated process
on 2014-08-18 |
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| Project Comments |
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Project Status
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Permanent Draft
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Project Relevance
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Sequencing Center
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Broad Institute
(USA)
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Collaborating Institute
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Funding Agency
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Project Description
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Enterococcus faecium H17243 Genome sequencing
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| Is JGI Project |
No
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Project Information Visibility
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Public | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROJECT TYPE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Specimen
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Organism |
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Nucleic Acid
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DNA |
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Sequencing Strategy
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Whole Genome Sequencing
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| EXTERNAL PROJECT LINKS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Project Information
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Database
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Genome Publications
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Other Publications
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| SRA Experiment |
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| PROJECT COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Study |
Genome Sequencing of Enterococcus, Broad Institute |
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| Organism |
Enterococcus faecium H17243 |
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| Analysis Projects |
Enterococcus faecium H17243 |
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| Number of Analysis Projects (AP) |
1
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| Number of Derived Analyis Projects (DAP) |
0
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| SEQUENCING INFORMATION | |
|---|---|
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Sequencing Status
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Complete |
| Sequencing Quality (MIGS-31) |
|
|
Finishing Goal
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|
Sequencing Comments
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Sequencing Technology
(MIGS-29)
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Illumina |
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Library Method
(MIGS-28)
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|
Number Of Reads
|
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Read Size
|
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Vector
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| GC Percent |
38
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| Chromosome Count |
|
| Plasmid Count |
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| ORGANISM NAME | |
|---|---|
| GOLD Organism ID |
Go0020369 |
| Organism Name |
Enterococcus faecium H17243
|
| Other names (alias, synonyms, short names, common names) |
|
| Organism Domain |
BACTERIAL
|
| Phylogeny |
FIRMICUTES
|
| Genus |
Enterococcus
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| Genus Synonyms |
|
| Species |
Enterococcus faecium
|
| Subspecies |
|
| Species Synonyms |
|
| Strain |
H17243
|
| Strain Synonyms |
|
| Serovar/Cultivar |
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| Culture Collection ID |
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| Type Strain |
Unknown
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| Exemplar DOI |
|
| Exemplar Name |
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| Taxon DOI |
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| Biosafety Level |
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| Organism Comments |
|
| Cultured |
Yes
|
| Culture Type |
Isolate
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| Organism Type |
Natural
|
| Uncultured Type |
|
| Commercial Strain |
|
| Commercial Strain Comments |
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|
ORGANISM TAXONOMY
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| NCBI Taxonomy ID |
1157444 |
| NCBI Superkingdom |
Bacteria
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| NCBI Kingdom |
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| NCBI Phylum |
Firmicutes
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| NCBI Class |
Bacilli
|
| NCBI Order |
Lactobacillales
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| NCBI Family |
Enterococcaceae
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| NCBI Genus |
Enterococcus
|
| NCBI Species |
Enterococcus faecium
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| ISOLATION CLASSIFICATION | |
| Ecosystem |
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| Ecosystem Category |
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| Ecosystem Type |
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| Ecosystem Subtype |
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| Specific Ecosystem |
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| ORGANISM EXTERNAL REFERENCES | |
| Strain Info ID |
|
| Genbank 16S ID |
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| GENERAL PROPERTIES | |
|---|---|
| Oxygen Requirement |
|
| Cell Shape |
|
| Motility |
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| Sporulation |
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| Temperature Range |
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| Salinity |
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| pH |
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| Cell Diameter |
|
| Cell Length |
|
| Color |
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| Gram Staining |
Gram+
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| Biotic Relationships |
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| Symbiotic Physical Interaction |
|
| Symbiotic Relationship |
|
| Symbiont Name |
|
| Symbiont Taxon ID |
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| Cell Arrangements |
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| Diseases |
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| Known Habitats |
|
| Metabolisms |
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| Phenotypes |
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| Energy Sources |
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