ANALYSIS PROJECT INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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GOLD Analysis Project ID
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Ga0415473 |
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Analysis Project Name Prefix |
Oryzias javanicus RS831 |
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Analysis Project Name Suffix
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Analysis Project Type
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Genome Analysis (Isolate) |
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IMG Submission ID
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Completion Status |
Incomplete |
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IMG Completion Date
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PI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Analysis Project Description
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GOLD analysis project created from public NCBI/GenBank data. |
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Visibility | Public | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ANALYSIS PROJECT METADATA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Assembly Method
(MIGS-30)
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SmartDeNovo v. MAY-2017; ARCS v. 1.0.1;Canu v. 1.5 |
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IMG Decontamination
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No |
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IMG Decontamination Method
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Scaffold Count
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Contig Count
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Gene Calling Method
(MIGS-32)
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Gene Count |
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Estimated Size |
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Sequencing Depth
(MIGS-31.1)
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76.5x |
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Annotation Pipeline |
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Added By |
JGI automated process
on 2019-10-21 |
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Last Modified By | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ORF Comparison Tools
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16S Recovered
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16S Recovery Software
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PROJECT EXTERNAL REFERENCES | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMG Taxon ID
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Genbank Accession
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Genbank Release Date |
2019-01-08 |
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ANALYSIS PROJECT COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Study |
Oryzias javanicus RS831 genome sequencing |
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Number of Studies
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1 |
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Number of Projects
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1 |
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Number of Related Analysis Projects
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0 |
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