Studies
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53,970 |
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Biosamples
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170,233 |
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Sequencing Projects
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480,729 |
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Analysis Projects
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360,451 |
| Organisms | 467,880 |
| ANALYSIS PROJECT INFORMATION | |||||||||||||||||||||||||||||||
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GOLD Analysis Project ID
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Ga0174824 |
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| Analysis Project Name |
Phytobacter ursingii CAV1151 |
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Analysis Project Name Suffix
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Analysis Project Type
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Genome Analysis (Isolate) |
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IMG Submission ID
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117850 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Completion Status |
Complete |
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IMG Completion Date
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2017-03-09 |
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| PI | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Analysis Project Description
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Submitting a public genome from NCBI/GenBank to IMG for analysis. |
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| Visibility | Public | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ANALYSIS PROJECT METADATA | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Assembly Method
(MIGS-30)
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HGAP3 v. 2.2.0 |
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IMG Decontamination
|
Yes |
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IMG Decontamination Method
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PhiX decontamination |
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Scaffold Count
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5 |
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|
Contig Count
|
5 |
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|
Gene Calling Method
(MIGS-32)
|
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| Gene Count |
6141 |
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| Estimated Size |
6166452 |
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Sequencing Depth
(MIGS-31.1)
|
89X |
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| Genbank Anomalous Assembly |
No |
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| Genbank Anomalous Reason |
|
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| Annotation Pipeline |
IMG Annotation Pipeline v.4.14.6 |
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| Added By |
JGI automated process
on 2017-02-21 |
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| Last Modified By |
JGI automated process
on 2017-11-17 |
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|
ORF Comparison Tools
|
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| PROJECT EXTERNAL REFERENCES | |||||||||||||||||||||||||||||||
|
IMG Taxon ID
|
2718217853 |
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Genbank Accession
|
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| Genbank Release Date |
2016-11-25 |
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| ANALYSIS PROJECT COMPOSITION | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Study |
Genome sequencing of carbapenemase (KPC) producing Gammaproteobacteria strains |
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Number of Studies
|
1 |
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|
Number of Projects
|
1 |
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|
Number of Related Analysis Projects
|
0 |
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